Plusieurs vestiges du premier âge du Fer jusqu'à la période gallo-romaine étaient déjà répertoriés à Villejames. Les archéologues s'attendaient par conséquent à découvrir des vestiges correspondant à ces périodes. Cependant, sur l'emprise de la fouille, outre des traces d'implantation humaine remontant à la période gauloise (Ve siècle avant notre ère), les vestiges les plus spectaculaires mis au jour sont ceux du manoir des seigneurs de Villejames, dont on ignorait jusqu'alors l'emplacement.
L'existence du manoir apparaît dans les archives de la famille Calon, ses propriétaires,  riche famille de négociants du pays guérandais mentionnée dès le début du XIVe siècle. Anobli à cette époque, devenu seigneur de Villejames, il fait construire son manoir sur des terres qui lui sont octroyées. L'édifice connaît alors divers aménagements architecturaux jusqu'au début du XVIIe siècle, où il est définitivement abandonné. Chronologiquement, la fouille archéologique concorde les sources écrites : le manoir est remanié à plusieurs reprises durant les trois siècles de son existence (réfections, ajouts ou destructions).