Dans la conduite des diagnostics et des fouilles, l'Inrap collabore chaque année avec plus de 700 partenaires privés et publics. Ce sont principalement des aménageurs fonciers, des sociétés d'autoroutes, des exploitants de carrières, des conseils régionaux, des conseils généraux, des communautés de communes, des villes, des entreprises publiques, des offices HLM…