Après l'achèvement des fouilles sur le terrain, l'exploitation des données scientifiques se poursuit ensuite dans la base archéologique. Elle débute par un premier classement de l'ensemble de la documentation réunie, l'achèvement du nettoyage et le marquage du mobilier.
A partir de ce moment, un planning est élaboré et les missions réparties entre les membres de l'équipe. A ce stade, la composition de l'équipe change : les effectifs qui se consacrent à l'exploitation des données sont généralement moins importantes que les effectifs déployés sur le terrain. Certaines tâches spécifiques peuvent être confiées à de nouveaux intervenants, collaborateurs plus ou moins spécialisés selon la nature des vestiges rencontrés.

Dans un premier temps, la priorité sera donnée à la datation des structures pour pouvoir reconstituer la chronologie relative à l'ensemble du site. Les successions stratigraphiques observées sur le terrain sont restituées et confrontées au matériel découvert pour obtenir une datation des occupations humaines successives.
Sur la base d'un premier plan global de toutes les structures, des plans d'ensemble par phase chronologique, sont établis. Les plans et coupes des structures représentatives sont sélectionnés pour une mise au net, ainsi que des coupes plus globales.

On obtient ainsi une image d'ensemble du site : se dessinent les bâtiments d'habitation, les zones artisanales, les enclos, les aménagements agraires, les espaces funéraires…